Título: IDENTIFICAÇÃO DE SEQUÊNCIAS DE DNA SATÉLITE NO GENOMA DE ESPÉCIES DE Piper L.

Autoria de: Lara Beatriz Oliveira

Orientação de: Giovana Augusta Torres

Coorientação de: Liliana Rocivalda Gomes Leitão

Presidente da banca: Giovana Augusta Torres

Primeiro membro da banca: Liliana Rocivalda Gomes Leitão

Segundo membro da banca: Marcelo Antônio da Trindade

Palavras-chaves: Piper capense, Piper sarmentosum, Piper caninum, Sequência Satélite, Repeatexplorer

Data da defesa: 25/05/2023

Semestre letivo da defesa: 2023-1

Data da versão final: 01/06/2023

Data da publicação: 01/06/2023

Referência: Oliveira, L. B. IDENTIFICAÇÃO DE SEQUÊNCIAS DE DNA SATÉLITE NO GENOMA DE ESPÉCIES DE Piper L.. 2023. 27 p. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas Bacharelado)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2023.

Resumo: As espécies de Piper L. endêmicas das regiões orientais da África e Ásia são popularmente utilizadas pelas culturas locais como matéria-prima na gastronomia e na medicina tradicional devido suas propriedades culinárias e terapêuticas. Dentre as espécies, três se destacam por apresentarem alto valor sociocultural nessas regiões Piper capense, Piper sarmentosum e Piper caninum. Estudos genômicos, incluindo a caracterização da fração repetitiva, são escassos no gênero Piper e ausentes nessas três espécies. Na fração repetitiva, os DNAs satélites são elementos fundamentais, visto que participam de modulações gênicas que interferem nos fenótipos das plantas. Essas sequências podem ser identificadas e caracterizadas por meio da plataforma Repeat Explorer, a partir de dados de sequenciamento genômico. Para melhor compreensão da organização genômica de P. capense, P. sarmentosum e P. caninum foram caracterizadas as sequências satélites de seus respectivos genomas. Os dados de sequenciamento genômico de baixa cobertura dessas três pimenteiras foram extraídos do banco de dados European Nucleotide Archive (ENA) e essas sequências foram pré-processadas no Repeat Explorer. A ferramenta Tarean foi usada na identificação dos satélites e a identidade e similaridade das sequências foi determinada por meio do alinhamento MAFFT no software UGENE. A abundância dos satélites foi visualizada na forma de gráfico Bubbles construído no software R. Cinco DNA satélites foram identificados ?? PcaSat1, PcpSat2, PcpSat3, PcpSat4 e PsaSat5 ?? e se observou heterogeneidade no padrão de abundância, devido a variações no número de reads mapeados contra o genoma de cada espécie. PcaSat1 foi o único satélite compartilhado em P. caninum e P. sarmentosum, com valores de 1094 e 33 reads, respectivamente. Os demais satélites foram exclusivos de cada espécie. Concluiu-se que as sequências de DNA satélite de P. capense, P. sarmentosum e P. caninum são sequências recentes, uma vez que foram exclusivas de cada espécie.

URI: sip.prg.ufla.br/publico/trabalhos_conclusao_curso/acessar_tcc_por_curso/
ciencias_biologicas_bacharelado/20231201910675

URI alternaviva: sem URI do Repositório Institucional da UFLA até o momento.

Curso: G012 - CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (BACHARELADO)

Nome da editora: Universidade Federal de Lavras

Sigla da editora: UFLA

País da editora: Brasil

Gênero textual: Trabalho de Conclusão de Curso

Nome da língua do conteúdo: Português

Código da língua do conteúdo: por

Licença de acesso: Acesso aberto

Nome da licença: Licença do Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras

URI da licença: repositorio.ufla.br

Termos da licença: Acesso aos termos da licença em repositorio.ufla.br

Detentores dos direitos autorais: Lara Beatriz Oliveira e Universidade Federal de Lavras

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